चंद्रयान-3 के विशिष्ट वैज्ञानिक लक्ष्य निम्नलिखित हैं:
Moon की सतह की संरचना और भूविज्ञान, विशेष रूप से दक्षिणी ध्रुव ऐटकेन बेसिन की जांच की जा रही है।
चंद्रमा के ध्रुवीय क्षेत्रों में पानी की बर्फ की तलाश की जा रही है।
चंद्रमा के वातावरण और धूल के वातावरण का अध्ययन किया जा रहा है।
भविष्य में मानव चंद्र अन्वेषण की संभावना की जांच करना।